Пытаюсь увеличить процент антиплагиата, но не могу понять как избавиться от красных подчеркиваний в документе Word?
К сожалению, если Вы пытаетесь увеличить антиплагиат простыми методами автозамены русских букв на их аналоги, то программа Word это сразу выявит. Но это не самое главное! Нужно учитывать, что начиная с 2013 года антиплагиат онлайн позволяет проверить документ с учетом подключенных словарей русского языка и некоторых иностранных языков. По этой причине любая автозамена будет выявлена и даже, если Вы загрузите на антиплагиат онлайн большой текст, система выдаст ошибку: неизвестные слова: выше нормы. 
Соответственно нет никакого смысла скрывать красные подчеркивания в программе Word. Такой документ не пройдет проверку ни при каких условиях!